打击下接连失败了两次。
轩辕带领部队继续追击蚩尤残兵，战争延续了不少时日，蚩尤引领轩辕来到夸父带领的主力部队埋伏的涿鹿之野河北涿鹿县。双方展开决战，史称“涿鹿之战”。
在涿鹿郊野，两军摆开阵势大战。蚩尤使用魔法，摆出了毒雾阵，把黄帝的军队围困起来，三日三夜大雾不散，至使兵士辨不清方向。但是，黄帝驾着谋臣风后发明的指南车，指挥军队冲出了毒雾阵。与此同时，九天玄女以西王母的名义前来助战，教导黄帝三宫秘略五音权谋之本传说为天书，包括兵书战策、帝王心学、风水玄学、音律、房中术等。风后据之又演化出遁甲之法，即奇门遁甲。传说九天玄女是风水玄学的创始人。
蚩尤又派魑魅魍魉各蛮族去作战，黄帝则叫兵士们击鼓，吓跑了这些鬼怪蛮族们。
传说中的魑魅魍魉都是一些杂牌小妖，据说魑魅魍魉专吃美女，外表大多以高大、红身、尖耳、头长角为主要特征，民间传说在荒野无人的深山，山下四野又多古老的森林。走长途的人，尤其是走夜路的，常常遇上山魈鬼怪、魑魅魍魉，都是木、石、禽、兽变的。
蚩尤请风伯，雨师纵风下雨，蓄水以攻黄帝。黄帝请来天女魃于东荒止雨。
反映战斗过程中，双方先由巫师作法，希望借助自然力征服对方，蚩尤来自长江流域，习惯雨中作战；而有熊氏来自长城以北，习惯干旱环境。当时大雨连绵不绝，对有熊氏作战极其不利，黄帝军队被大水淹没，且夸父早就埋伏在此，突然加入战场，使黄帝军队几乎陷入绝境。
危急中，黄帝只得请下天女旱魃阻止风雨，天气突然晴霁，雨水停止。这代表着当时气候的剧烈变化，太阳黑子活跃期到来，华北地区由以前的多雨时期转入长时间的大旱。
蚩尤军队惊诧万分，黄帝在大将风后、力牧的辅佐下，乘机指挥大军掩杀过去，先后杀死了蚩尤的八十一个兄弟部落首领，并最终活捉了蚩尤。黄帝命令给蚩尤带上枷锁，然后处死他，地点在山西运城解州。传说蚩尤有不死之身，所以黄帝将其分尸葬于四处，使之不得完尸。
黄帝的胜利得来不易，而胜利以后，又遇到很多新的困难，不仅旱神女魃制止了大风雨后神力大减，“不得复上”，应龙参战以后，也“不得复上”，天上“无复作雨者”，使地上连续大旱数年。
近代环境考古告诉我们，黄帝统治时期是自然环境又一次大变化时期，不断升高的气温，开始北方干旱、南方洪涝的现象。涿鹿之战中，那些被巫术呼唤来的暴风雨及其后的干旱，正与气候由平稳到发生波动的情况相合，可见这些神话不是全无根据的，它确实浓缩了对过去的回忆。
战后，黄帝率兵进入蚩尤的家乡、良渚文化的中心地区九黎地区，人流散，与之相关的民族有苗族、汉族、羌族等。
1汉族：蚩尤败后，大部分族人融于炎、黄集团，从而成为华夏族，乃至当今汉族的先民。一些汉族姓氏和蚩尤有关，如邹、屠、黎、蚩等。王嘉拾遗记载：“轩辕去蚩尤之凶，迁其民善者于邹屠之地，迁恶者于有北之乡。其先以地命族，后分为邹氏屠氏”。邹姓、屠姓今为汉族常姓。
第四章 蛮夷的由来（）
“有北之乡”指北方寒冷不毛之地，见于诗小雅巷伯，孔颖达疏：“北方太阴之气寒凉而无土毛，不生草木，寒冻不可居处”。说明曾经有一部分蚩尤遗裔被迁到北方。蒙古族学者陶克涛著毡乡春秋匈奴篇，论蚩尤是匈奴在传说时代的称号，被黄帝北逐的荤粥当是蚩尤部落遗裔。司马贞史记索隐释荤粥：“匈奴之别名也，唐虞尧舜以上曰山戎，亦曰熏粥，夏曰淳维，殷曰鬼方，周曰猃狁，汉曰匈奴”。
上面的说法将不同历史时期的几个重要的部族合并为一个民族。只是不断地换名字，失之于草率。实际上广阔大地上到处分布着无数的部落，每一个都是民族的备选者。
实际上华夏周边的民族其实最开始基本都为中原王朝臣民，只是因为战事牵连，以致不得不流浪到蛮荒，然后由于资源短缺，诸部落互不相下，在混战中产生某一领导部族，统一一定地区，形成大型部落，然后引起中原王朝的警觉甚至开始侵略中原王朝，以致在史书中才留下名字，而这个族名实际上开始只是某一小部落的名字，但由于他们成为草原或平原的统治者，才成为冠之以整个地区部族的名字，似乎他们都是这一民族的人。
而由于蛮荒地区经常发生自然灾害，今天强盛的部族，明天不一定强盛，一旦作为统治部落的部族实力下降，就会引来内部部落的反叛乃至外来势力如中原王朝的讨伐。一旦失势，随之而来的就是地区的长期混战，直到再次出现新的领导部族。
这一特点体现在秦汉以来的各个历史时期，比如匈奴统一了大草原，等到汉武帝击败了他们；鲜卑统一了大草原；等到鲜卑离开草原入主中原，北方又出现新的领导民族并不因为鲜卑是他们的故主，就有丝毫的容让；之后又有蒙古族等。所以被统治的草原民众始终是那些人，只不过统治部落换了，这些人也就换了一个族名。而当地人也习以为常，为了适应这一特点，草原民族的战争方式也有所不同：每次战争，最激烈的情况就是将敌人的成年男丁高于车轮的杀死，而小孩和女人则作为部落的财富带回来，为部落的繁衍壮大提供了有利条件。
但是因此就说他们是一个民族，也不正确，因为他们的风俗都完全不同。但基层牧民生活变化不大。其人种虽然大都是与中原王朝差不多，但是由于来自西方大草原的雅利安人势力也渗透进来，所以人种出现混杂的情况。后世的白匈奴就是指的如羯人一样的白种人。所以其与中原王朝的人的关系也日渐疏远。这种渗透的情况以西域最多。
风伯雨师是农耕蚩尤部落专司气象的巫师，后为农业气象神，立有庙，岁时奉伺。韩非子十过说：“昔者黄帝俣鬼神于泰山之上蚩尤居前，风伯进扫，雨师洒道”，反映了风伯雨师与蚩尤部落之密切关系，因为农业部落生产的丰收是与风调雨顺分不开的。管子五行亦有黄帝重用蚩尤的记载：“昔者黄帝得蚩尤而明于天道蚩尤明天道，故使为当时”。“当时”是中原黄帝部落联盟的一种公职名称，其地位与职能约与周礼中的“天官”相类，亦近似于后世各朝之宰相，是辅佐部落联盟首领帝管理各部落公共事务的部宰。此处所言之“天道”，是指天文历法岁时月令的经验知识。熟悉这些知识，是安排农业部落生产生活，管理好农业部落社会的关键。
说明在蚩尤战败身亡后，继任首领仍称蚩尤并臣服于黄帝，成为六相最重要的天官。主管历法、刑法、青铜制造。
2蚩尤是苗族的大祖神，具有非常崇高的地位。苗族先民本为炎帝中的一支，在上古时代本来居住在黄河流域，由于被华夏族所败，被迫迁徙至今天的贵州和湘西、鄂西南等地区。
3一部分族人向他处迁徙，形成了后来的三苗。根据后汉书西羌传，三苗部分族人向西迁徙，蚩尤是羌族的先祖。
原来蚩尤威震长江流域及黄河流域。但是被黄帝击败后，被迫臣服于其威势的东夷各族纷纷**，黄帝见此情况，开始宣传蚩尤没有死，已经被自己收服为自己的军队统帅，黄帝尊蚩尤为“兵主”，即战神，他勇猛的形象仍然让人畏惧，黄帝把他的形象画在军旗上，用来鼓励自己的军队勇敢作战，威慑还没有**的东夷各族。龙鱼河图说：“灵尤没后，天下复扰乱不宁。黄帝遂画蚩尤形象以威天下。天下咸谓蚩尤不死，八方万邦皆为殄状。”
由此可见，蚩尤在九黎部落联盟战略被擒杀而死以后，黄帝及其族人们就将蚩尤的形象用来威吓天下八方，从而将蚩尤变成了自己的保护神，并对蚩尤加以崇敬和缅怀。诸侯见蚩尤像不战而降。
黄帝又亲率兵马征伐各方不肯臣服的诸侯。前后共经52战，天下始归一统。东夷各族臣服黄帝。
蚩尤为中国古代文明作出了重要贡献，是中国古代文明的伟大缔造者之一。
第一、蚩尤为物质文明作出了重要贡献。当时，蚩尤统率的九黎部落联盟，生活在黄河中下游和长江中下游一带，是一个面对海河而生长起来的部落，是当时三大部落联盟中最强大的部落联盟，物质文明已经有了较大的发展。以当时最发达的良渚文化为标志。
第二、蚩尤在华夏较早发扬了金属冶炼和金属兵器的制造。世木作篇说蚩尤“以金作兵器”。管子地数说：蚩尤能以金为兵，制作“剑铠矛戟”。
第五章 黄帝封禅泰山（）
第三、蚩尤是华夏建立法规、实行法制的最早创造者和施行者。蚩尤首创法规，实施刑事法，以肃纲纪。周书吕刑说：“蚩尤对苗民制以刑”，就是一个有力的佐证。路史后纪四蚩尤传在记述蚩尤被擒杀后说：“后代圣人著其尊彝，以为贪戎。”罗萍注曰：“蚩尤天符之神，状类不常，三代彝器，我著蚩尤之像。为贪虐者之戎”。龙鱼河图说：“灵尤没后，天下复扰乱不宁，黄帝遂画蚩尤形象以威天下。天下咸谓蚩尤不死。八方万邦皆为殄状。”说明蚩尤严格实行法制而树立了威严的形象和产生了深远影响。“上效蚩尤重刑以变九黎言苗民者。”这也同样说明，蚩尤是刑法的首创者和施行者。后来被黄帝部落集团效法。可见，蚩尤乃是中国古代法制的缔造者。
天下有不归顺的，黄帝就前去征讨，平定一个地方之后就离去，一路上劈山开道，从来没有在哪儿安宁地居住过。黄帝四处迁徙，没有固定的住处，带兵走到哪里，就在哪里设置军营以自卫。黄帝往东到过东海，登上了丸山和泰山。往�