掉”口“字楼，部队设施由工兵负责进行爆破；（五）尔后，包括少年兵在内，整个部队在严密的统率下南下至通化。
石井部队长和菊地部长进行激烈争论的原因，在于石井方案中的（二）和（三）。菊地少将认为：“731部队内有许多有才能的研究人员，与其强迫他们白白自杀，不如想出一个拯救支队的方法，这才是先决条件。”他气愤地说：“部队长应努力率领部队人员的家属先回国。”对石井部队长平日沉迷于酒色、工作放荡的态度，许多干部一直是很不满的。
结果，石井部队长做出让步，得出结论是“马上开始撤走家属，部队长前往各处，找火车，指挥各支队撤退。”石井部队长再次从731部队中消失。
其间，石井四郎干了三件事：第一，把731部队为进行细菌战准备而积存的各种资料和庞大的实验资料、菌株等送回日本进行准备；第二，安排731部队撤退列车优先通过，以免被苏军逮捕。为此，石井四郎充分利用731部队航空班的军用飞机，飞往长春、沈阳等城市。
石井四郎干的第三件事是：特别班人员的紧急避难。千代田村里有一个叫做加茂的小村落，特别班人员多是这个村落人，就是今天千叶县芝山町加茂地方。石井四郎于1933年创建细菌战部队时，把部队起名为“加茂部队”。这一名称的由来就是这一村落，特别班名副其实地是731部队的核心骨干。
“处理‘马鲁太’以后，全体人员立即紧急撤退”，这是石井部队长对特别班人员下达的手谕。即在731部队中优先安排同乡出身的特别班人员逃跑。
来自平房站的货车已有三列进入了731部队的专用铁路线，这些满载特别班人员和贵重资料的货车11日从平房发车。
据说，至8月10日，被关押的“马鲁太”总人数已不到40人，关于如何处置掉“马鲁太”的问题，有关人员过去有种种说法，如“用氰酸化钾毒死”、“全部枪毙”等等，其中有的说法还印成文字。真相究竟如何呢？
据我的调查，“马鲁太”是用毒瓦斯杀害的。据说，犯人发生暴动以后，特设牢房换气系统很快把毒瓦斯注入了毒气管道。
“简直像观看大猩猩在善栏里发狂一般”，这是一个亲眼看见残杀全体“马鲁太”情景的部队人员说的。
在“马鲁太”中，有几个人未被毒瓦斯杀死，他们敲打着铁门，发出令人恐惧的吼声，乱挠着喉咙，无比的痛苦。特别班人员慢慢地走近不胜痛苦的“马鲁太”跟前，对准他们的脑门扳动了毛瑟枪扳机。“不断地拖着杀掉了的‘马鲁太’”的腿，扔到7号楼旁的一个大坑里，浇上汽油和重油，点了火我记得，那是11日下午的事。为了进行烧毁，731部队的焚尸炉里塞满人头标本、培养细菌用的琼脂、大量的文件和器具等。‘马魯太’的尸体不太容易烧掉，可是撤退工作正在争分夺秒，慌忙逃跑的特别班人员们把尸体烧了一半就埋上土逃之夭夭因此，有的尸体手脚从土中露了出来，难以发挥掩盖罪行的作用。部队干部看到这种情况后命令说：‘再把尸体挖出来彻底烧掉’负责挖掘瞠目硬挺的‘马鲁太’尸体的部队人员边恶心边进行挖掘“，一个部队人员回忆道。
单人牢房墙上的血书
731部队急于处理的不仅仅是“马魯太”，还有1号楼二层“陈列室”以及第一部各课研究班里的许多人体标本。泡在大小容器内福尔马林溶液中的人头、手腕、躯体、腿以及各种内脏标本都是按传染病的种类、病情等制成的成套标本。
标本大约有1000多个，都是731部队进行残酷活体实猃的证据。
绝不能让一个标本落到进攻的苏军手中根据上级的命令，10日深夜出动了卡车。
“从10日傍晚到深夜，哈尔滨市一带下雨，冒着雨把装有福尔马林溶液的器皿装上了卡车。运载着几十几百个的人体标本的卡车，从731部队出发，深夜中驶抵松花江岸，利用黑夜将标本都扔进了松花江。由于撒退仓促，未能把全部标本都装上卡车”，原部队人员这样回忆道。
“处理”一再增产而库存的各种细菌、大量老鼠和几亿只跳圣也是紧迫的大事。此外还有731部队各研究班保存的庞大的实验资料。其中，在中国各地进行细菌战的详细记录、解剖记录、病理记录、各种实验记录和培养细菌的记录等堆积如山。在10、11日两天内，他们在部队驻地内匆忙地挖了许多坑，把这些资料放进去，浇上重油加以烧毁。在从大学研究室抽调到731部队的学者中，有的人对于烧毁这些难得的研究资料感到可惜，想悄悄地把它带回国内；也有的人把这种人体实验记录往皮包里塞，准备带回去，以便将来在学会里出名。这种情景被发现后，有的学者挨了上司的严厉呵斥。不过，那时谁都不知道明天自己会怎样，他们的真正动机只是不忍心让贵重的纯学术资料化成灰烬。
当务之急是毁灭器材等，为数甚多的细菌培养器、冷冻设备、显微镜、化学天平和陶器炸弹等等。这些东西都要全部毁掉。
最困难的是破坏建筑设施。尤其是那座利用特殊钢材和近50公分厚的水泥墙盖起来的特设牢房，十分牢固，必须出动工兵队，在牢狱里的十几个地方放上炸药，进行爆破。
为了进行爆破，就要在特设牢房的地面和楼梯下挖很深的洞，教育部下属的人员奉命执行这项任务。
部队人员拿着铁镐和铁锨走进特设监狱单人牢房的一剎那，都吓得呆立不动了。
“马鲁太”的尸体已经运走，空荡荡的牢房里，充满消毒用的石碳酸味，直到昨天为止还紧闭的“马鲁太”地狱还留有痕迹，潮湿的冷风穿过了7号楼二层单人牢房前宽敞的走廊。他们之所以吓得呆立不动是因为他们发现在单人牢房墙上写满了大字。在不少地方已经剥落的水泥墙上闪耀着黑紫色的大字：“打倒日本帝国主义！”“中国共产党万岁！”
每个字约为20厘米见方。监狱里根本无法搞到笔墨，一看便知道那是用鲜血写成的。这恐怕是他们用满是鲜血的手掌，含着无比仇恨，躲开看守的监视写成的吧！这些一笔一划写成的大字，具有一种威力无边的力量，能够很自然地触动站在墙前人们的灵魂。个个黑紫色的字迹，像高压电流般地冲击着这些慌忙进行战败处理的731部队人员的大脑，使他们麻木了。
“我看到墙上的字时，受到了冲击，也许是在通过实验被杀害之前，他们竭尽全力写成的吧！我不懂得什么是共产党、什么是‘主义思想’，但是，却受到了一种无法形容的冲击。我直感到，世界上竟还有在最后时刻仍保持着如此信念的人，他们不是‘马鲁太’，而是勇敢的人”，当时曾经在牢房墙壁血书前站立过的一个部队人员这样追忆道。
墙上的血书是书写者为继续鼓舞后来不断关押进来的犯人为民族解放和维护人类的尊严坚持到最后而留下的。部队人员停下了挖爆破坑的作业，在墙壁前面默默地呆了一会儿。
由于苏军进攻迅速，哈尔滨市内陆军医院挤满了从前线撤下来的日本伤兵，火车站前的广场上，逃难的人也拥挤得混乱不堪。
已经一刻也不能再迟疑下去，“口”字楼内的各个房间和走廊里都巳浇上了重油并巳点了火。在滚滚的黑烟中，发出一声震撼整个建筑的巨响，特设监狱的墙由于工兵的爆破而倒塌了。
恶魔城的崩溃
到了8月11日夜晚，731部队的内部陷入了极大的混乱。撤退用的专用列车开进了来自平房的货车专线，开始撒退兵员。
“全体人员立刻上车！每人只许带两件手提行李，不许提取存款。”
11日下午，东乡村宿舍贴出了这样的“通知”。“苏军已进入哈尔滨市内，好像开始了巷战。”谣传四起，整个宿舍内为之骚然。各家都开始准备路上吃的东西和捆行李。虽说是捆行李，但家具什物几乎都不得不扔下不管。为了争分夺秒地撤走，许多家属顾不得烧水洗澡，柜子的抽屉也敞开着，就领着孩子徒步走到平房车站，挤上了货车。
听说撤退回国，少年兵营里响起了欢呼声。对少年兵来说，回到在梦中见到的父母身边，是和战况推移无关的好消息。731部队里的零售商店开门了，少年们推着满载准备带回家的土特产的手推车回到了少年兵营，
衣服和甜食是少年们最欢迎的东西。从器材部仓库运来了大米、小麦、酱油和砂糖等，把这些东西铺在开入专线的货车车厢底上，作为撤退途中部队人员和家属的食物。从宿舍搬来榻榻米铺在粮食上。虽说是货车，但却改造成了铺有榻榻米的临时客车了。往撤退专列上装的粮食和物资是不均衡的，有的车箱满载物资，有的车箱则空空无物，乘坐这类车箱的人苦于粮食不足。车辆和人混乱不堪，到处散乱地放着文件和物资。这个超过2500多人的大家族慌张撤退的同时，731部队的各幢建筑物设备都起了火。火药的爆炸声震耳欲聋，滚滚浓烟布满天空。
“毗邻的8372航空部队大吃一惊，赶紧派出消防车。我们的上司推却说：‘请不必担心，这是作战处理的需要，请回去吧！’731的机密和开始撤退的情况连友军也不能告诉”，一个原部队人员提供证词说道。
除石井部队长等干部搭乘的几架专用飞机外，航空班的飞机全都被炸毁。随着一阵轰隆的爆炸声，设有3台塔库马式锅炉的发电站化为乌有。东乡村的宿舍也一间间地放火燃烧起来，许多老鼠都从动物房里逃窜到周围平原上，从着了火的田中班所在楼里逃出了几百万只跳蚤。谁也不知谁在干什么，正在奉命干活的部队人员本身也陷入混乱和一心想逃跑的漩涡之中。
白金制的医疗器皿和蒸发器皿悄悄地从实验室的一角“失踪”了，部队保险柜里的几十万日元纸币被缝入了部队人�