随后，Zeratul和Artanis启动了Xel'Naga神庙，消灭了Shakuras上的Zerg。
消灭新主宰 Against the New Overmind
Kerrigan曾对DuGalle上将说过，“我不这样认为，上将。你看，就目前而言……我基本上是宇宙中最强悍的女王，而你那些微不足道的士兵和飞船根本挡不住我。”
地球联合理事会（the United Earth Directorate）获得了幽能干扰器，这是一个对付Zerg的强大武器，但指挥官DuGalle上将，却由于Samir Duran的建议而忽视了它的作用。Alexei Stukov中将背着DuGalle分解了这个干扰器，并隐藏了起来，但后来他却为此背负上了背叛的罪名。
利用对UED的畏惧，Kerrigan使Fenix、Jim Raynor和自己达成了联盟。由于过去在Korhal之子时，Kerrigan和Raynor相互爱慕，这使得Kerrigan很容易就劝服了他。Fenix并不完全相信Kerrigan。然而出于对UED的强大实力，Raynor说服了Fenix加入。
UED攻占了Korhal行星，Jim Raynor和Fenix的营救走了前皇帝Arcturus Mengsk，并来到Aiur行星，UED也追踪而至。在Aiur上，在Samir Duran的协助下，Kerrigan的部队再次解救了Mengsk和Raynor。在此期间，Duran出卖了UED，使DuGalle上将和Stukov中将反目，并杀死了Stukov，同时也暴露了自己的叛变。在Braxis行星上，UED重组了幽能干扰器，不过这使得UED必须分兵防守Braxis和Korhal两个行星。虽然干扰器给Kerrigan控制Zerg造成了很多麻烦，然而仅仅用一支行星驻军来保护它是个致命的错误，这给UED在Koprulu星区的失败敲响了丧钟。
宇宙中最强悍的女王
不久，UED攻占Char行星，捕获了新主宰。Kerrigan告诉DuGalle，她会消灭所有UED控制的所有Zerg。
在控制了一个脑虫后，Kerrigan决定开始和Arcturus Mengsk、Fenix和Raynor一起对抗UED。Mengsk只是她的俘虏，她威胁Mengsk说，如果拒绝合作，Mengsk余生只能做囚室中的皇帝。于是联军摧毁了能量干扰器，甚至感染了Moria行星上的平民。随后Kerrigan击败了Korhal行星上的UED。然而就在联盟休整的空虚时期，Kerrigan打破联盟，并杀死了Fenix和Mengsk的将军Edmund Duke。Raynor和Mengsk则逃脱了。对于Kerrigan的背叛，Raynor感到痛苦万分，他发誓要Kerrigan为此付出死的代价。
在打退UED的反击后，Kerrigan计划消灭新主宰。她再次回到Shakuras行星，去寻找女族长Raszagal。在Raszagal的命令下，黑暗圣堂武士没有启动Xel'Naga神庙。于是Kerrigan成功地绑架走了Raszagal。（事实上，是被控制的Raszagal自愿跟随而去的。）
复仇心切的Zeratul和Artanis尾随Kerrigan回到Char。Zeratul要求Kerrigan释放Raszagal，Kerrigan则提出Zeratul在杀死主宰后，她才释放Raszagal。Raszagal也让Zeratul听从Kerrigan的建议，声称主宰是对Kerrigan和Protoss的双重威胁。
虽然Zeratul知道杀死主宰只会让Kerrigan变得更加强大，但他没有别的选择，只能同意。黑暗圣堂武士参与了战斗，并消灭了Zerg和UED的联合部队，他也杀死了主宰。当他再次提出释放Raszagal时，Kerrigan同意了……但在Kerrigan的控制下，Raszagal却表示自愿留下。此时Zeratul才发现Kerrigan已经控制了Raszagal，最后他抢回了Raszagal，并且逃离。
Kerrigan命令Samir Duran抓回女族长，他们成功地摧毁了Protoss基地。然而Zeratul为了不让Raszagal被Kerrigan奴役，亲手杀死了她。惊讶的Kerrigan允许Zeratul离开，因为她想要Zeratul活在罪恶感中。与此同时，Samir Duran也失踪了。
现在，所有的Zerg都被Kerrigan统治了。在最终的决战中，Kerrigan打退了UED、Terran帝国以及Artanis部队所发动的联合进攻。她对UED试图控制Zerg十分憎恨，因此毫不留情地将UED远征军全部消灭，但她没忍心杀光曾经的同盟，竟然放任Terran帝国以及Artanis部队逃离。
目前
终于，Kerrigan成为了已知的宇宙中最强大力量的首领。她曾在最后大决战前夕说过，“此时此刻，我基本上是宇宙中最强悍的女王。”
在Char上，她不断增强着自己的实力，尽管有能力征服Terran帝国和Shakuras的Protoss，但她没有进攻。她在等待一个意想不到的危险敌人。
有证据表明Kerrigan对目前拥有的这些并不快乐，她仍然希望再次成为人类。在Korhal，她杀死Duke和Fenix后，曾说过，“自从变身以来，我第一次厌倦了这种屠杀……”
序幕
世界突然变得一片黑暗。
不，这并不是单纯的夜晚——没有任何一种夜幕能营造如此纯粹的黑暗，不，这是囚室的黑暗、被
蒙住双眼一般的黑暗。什么都看不见，无光，无影，只有一层令人窒息的东西遮蔽着视觉。与前一
瞬间那眩目的光线、恣意喷发的色彩产生了鲜明的对比。
我挣扎着想要弄清自己的处境。我在哪里？
没有任何回答。下一瞬间，一个更大的疑问笼罩着我，抹去了前一个。我是谁？
恐惧自我内心油然而生，夹杂着说不清道不明的愤怒，淹没了我。我不记得了。我不记得我是谁了
！
冷静，我告诉自己。要冷静。我强压下心头的恐惧，以坚决的意志抵制它，绝不能让它包围我、毁
灭我。然后我问自己。你想起什么了吗？
没有。
不对，有一些片段。一场战役。一场战斗。恐怖，恐怖的敌人，巨大的怪兽包围着我，我如此渺小
。背叛——尽管已无法回忆起具体的细节，我仍能感受到当时的痛苦。抛弃。绝望，末日临头之下
歇斯底里的挣扎。坚实的触感包围了我，令我窒息，一点一点地在杀死我。世界突然变得一片黑暗
，麻木随之在我体内蔓延。
然后就变成现在这样了。
我在哪里？我极力延伸我的感官，探察我的周围，我的感觉模糊而杂乱，可是最终，都只得出了同
一个结论。
我在被运送。
我能感觉到这种移动，与其所产生振动。但不剧烈——有什么东西垫着我，裹着我，全方位地缓冲
着这种振动。是这东西本身在移动，而我则被它运载着。
我试图用手敲它，但我的四肢无法听从指挥。我感到迟滞、虚脱——麻木。感官迟钝，身体像灌了
铅，可意识却古怪地清醒异常。我的身体在燃烧！我的血肉在蠕动、在爬行、在融化、在变形——
我再也无法控制我自己的身体了。我在变形。
我能感到我周围还有其他活物。它们并不像我那样被束缚——它们可以自由行动，尽管它们的意识
十分低级。是它们捕获了我，将我装进这个容器里运往目的地。
我能感受到它们的思想，划过我，穿过我，一部分的我畏缩不已，但另一部分——新的那部分——
欢迎它们的侵扰。那部分随着它们的话语摇摆，让我的身体与它们共鸣，进一步地改变我，让我更
为接近周围的那些生物。
尚属于我自己的部分，以前的部分，在恐惧中畏缩。不，我不能，我不想变成它们的同类！我要逃
走！我要自由！我的身体虽被囚禁，但我的意识延伸了开去，寻求帮助，任何帮助。我绝望地尖叫
着，只要能让人听到，不管是谁。
而我知道，在很远很远的地方，有人听到了我的祈求。
救救我！
碎石遍布四处，折射出一座燃烧的城市，一个已死的世界。建筑倾覆，交通瘫痪，大街上尸体横陈
。一块标牌仍立于这片废墟的边缘，它那焦黑的表面上用大字写着“欢迎来到”后面的新盖茨堡这
几个字现在只是一个锯齿状的黑窟窿。五花八门的尸体，从Terran苍白的躯体到Protoss光滑的外
皮到Zerg强壮的骨刃。人类，还活着的人类无处藏身，尖叫着四散奔逃，嚎哭着寻求帮助。一些人
疯狂凌驾了理智，他们挥舞着武器，绝望地想要保护自己和家人。也有些人缩在角落里独自垂泪，
无法面对这个世界的末日。剩下的少部分人则躲的躲，逃的逃，幻想着能逃离他们注定的宿命。
虫群忽略了他们，因为它还有一项更重要的议程。
这场战役并没有照预期那样发展。Terran以比预期少得多的兵力组织了一次次的的顽强抵抗。而
Protoss；该死的Protoss几乎无所不在，披着他们的闪亮的战斗套装，彰显他们的自大，不过很快
他们似乎失去了焦点，将注意力分到别处去了，好像他们不只在和一个敌人作战。在某些地方，虫
群还目击到了Terrans攻击Protoss；原因不明，但相当令人高兴。是的，这是一个奇怪的战场，敌
我双方在不断的变化。不过这只是圣灵要考虑的事。目前，战乱已经结束，这场战役已经打赢了。
残余的Terran构不成任何威胁，而Protoss则在取得了一定战果后突然消失了。出于某种考虑，他
们这次并没有夷平这个星球，这一事实令虫群取得了意想不到的收获——找到了一个宝贵的战利品
。
现在，它们互相联结的意识已经把注意力从这场战争放到眼前的事上来了，Zerg正在检阅它们的大
军，并准备胜利凯旋。
一个氏群清理出了一条道来，移走了尸体、碎石、金属等所有的障碍。另一个氏群尾随其后，紧紧
保护着那件战利品。中心部位是一群雷兽组成的一支紧密编队，它们的背刺几乎挨在一块，包围着
四个刺蛇怪，那四个刺蛇怪用前肢联合托着一个椭圆形的物体。那东西粘糙的茧壳正不断地以光的
形式辐射着脉冲，但在这座城市的熊熊火焰和爆炸所产生的闪耀的对比下显得尤为黯淡。
“当心，”这个氏群的脑体指示道，它通过漂浮在这个虫蛹上数个管�