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这下朱元璋怒了，皮球踢来踢去，竟没有一个有担当的肯承认错误。既然都不认错，那就都别安生了。于是把礼部负责接待的相关人员全都下狱，暗中让检校调查真正敢将此事压下隐瞒不报的指使者。明面上，两位宰相只被骂了一顿，并没有受到什么处罚。胡惟庸和汪广洋怀着惴惴不安的心情回到中书省，不知在中书省昏暗的烛光下，这两位老对头是否都从对方的眼中看到了绝望的神情——这绝望既是属于胡惟庸的，也是属于汪广洋的，甚至，是属于胡惟庸身后的李善长的。
锦衣卫挂牌（2）
命运的转轮既已启动，断无停下之理，朝中诸大臣都看出了朱元璋要把火烧大的决心。胡惟庸和李善长坐的宰相高位，表面光鲜无限，朝中有无数大臣眼红，早就想取而代之。这次在外交方面出了这么大的岔子，恐怕他们二人相位不保，自己何不落井下石，从中渔利呢？能扳倒一个是一个，说不定哪天那个耀眼的职位就能落到自己头上呢。
过了不久，占城外交接待事件调查结果出炉——汪广洋是罪魁祸首。朱元璋对这个调查结果并不满意，大家都知道汪广洋一向尸位素餐，要说他是主使者，别说朱元璋，恐怕那些参与调查的人也都不相信。这个调查结果看在朱元璋眼里，只能说明胡惟庸在朝中的势力太过庞大，已经完全架空他这个皇帝的权威，到了不除不行的地步了。但要除掉胡惟庸，必须有过得去的理由，而且总不能让皇帝自己去说，得由臣下发难才好，挑来选去，一个叫涂节的大臣被他挑中了。涂节是御史中丞，负有监察百官的责任，由他出面告发胡惟庸，很是合适。
为了不打草惊蛇，汪广洋仍然被牺牲掉了，他先是被贬官到广东，还没走到呢，朱元璋又追加一道圣旨，内容是说他以前当地方官的时候包庇犯法的宗亲朱文正，后来在中书省的时候明明知道杨宪的奸邪却不报告，结论是“赐死”。汪广洋几乎是以解脱的心情来接的圣旨，这样的场景，在他的梦里已经反复出现过无数次了吧，以前需要借助酒精的力量摆脱梦魇，这一次却是不用再担心什么了……
汪广洋只是身死，朱元璋没有连罪他的家人，但汪广洋有个陈氏小妾，得到汪广洋死去的消息后也跟着自杀了。古时丈夫死了，没有子女的妻妾从死，是贞洁的行为，很多帝王都会给这样的女人以表彰，但这个消息传到朱元璋的耳朵里，引起的却是反效果。随着陈氏小妾自杀殉夫的消息一起报告给朱元璋的是这个女人的身份——她是犯官之女，其父曾是个县令，因犯了法，妻女都被卖为官奴，不知怎么竟成了汪广洋的妾室。朱元璋知道后大怒：“从来官奴只能赏赐给功臣之家，汪广洋这样的文官怎么能纳之为妾呢？”
朱元璋立刻下令有司彻查，于是从胡惟庸到六部各官人人自危，很多人都感觉到了皇帝对胡惟庸的不满已经到达了极限。然而这个案子还没查完，胡惟庸已经掉了脑袋，汪广洋的小妾这样的事和“谋反”大事比起来，实在算不了什么，于是这桩案子就这么无疾而终，不了了之。
洪武十二年十二月，御史中丞涂节向朱元璋告发胡惟庸涉嫌谋杀诚意伯刘基——胡惟庸找人给刘基看病的事情广为人知，刘基此后不久就去世了也是事实，虽然这两者结合起来并不一定就是历史的真相。
不过朱元璋不需要真相，他需要的只是杀人的理由。
不知道胡惟庸洪武十三年的春节是怎么过的，反正御史中丞涂节没闲着，他觊觎丞相的位置很久了，如今揣摩上意，看到胡惟庸已经明显失宠，就准备给胡惟庸最后的致命一击。
洪武十三年正月初二，整个大明朝还沉浸在过年气氛中的时候，南京城里却剑拔弩张，涂节向朱元璋告发——中书左丞相胡惟庸意图谋反！
朱元璋接到报告后毫不含糊，立刻命人把胡惟庸抓起来，还没等涂节高兴呢，一转脸又说涂节本来就是胡惟庸一党，还拉上了曾经和汪广洋一起弹劾李善长的御史大夫陈宁，洪武十三年正月初六，朱元璋将这三个人一起杀了。
天威震怒，雷厉风行，大过年的，突然一下死了一个丞相、一个御史大夫和一个御史中丞。在胡惟庸死后发布的文告里，他的罪名是“擅权枉法”，罪行倒是一抓一大把，从肆意打压自己的对头到私扣奏章，从收受贿赂到专权独断，乃至于沉湎于声色犬马之中，几乎是无所不包。
在大臣们还没反应过来的时候，到了正月十一日，又有两道圣旨发布——废除中书省！废除大都督府！
锦衣卫挂牌（3）
两道圣旨把中书省和大都督府的后事安排得十分详尽，内容之缜密、细致，使朝中大臣们终于明白，朱元璋发布这两道诏令绝非一蹴而就，而是酝酿了很久的结果。
中书省作为大明朝最高行政机关的历史到此结束，从此退出了历史的舞台。整个中书省的官员编制几乎全被废除，只保留了纯粹记录官性质的中书舍人一个职位。原本属于中书省的权力全部收归皇帝一人所有，吏、户、礼、兵、刑、工六部尚书的地位上升，他们直接对皇帝负责，王朝政务的决策者和实行者之间再无任何阻碍。同时，朱元璋还告诫群臣——今后他的子孙，都不能再说设立丞相的事情，臣子们也不能请求设立丞相，不然就是死罪！
而大都督府则被分割成中、左、右、前、后五军都督府，这五军都督府掌管军旅之事，隶属于兵部，曾经和中书省分庭抗礼的大都督府编制就这么消失了。
洪武十三年的春节，注定是让大明朝所有官员都难忘的一段日子。
混乱的正月过去后，朱元璋真正开始了至高无上的皇权运作。
现在的大明朝，没了中书省的宰相掣手掣脚，朱元璋的皇权达到了历史的顶峰。但权力必然伴随着义务，没过多久，这至高无上的权力所带来的副作用就显现出来了。
身为皇帝，他必须要保证整个大明朝的正常运做，但他不是神，只是人。从科学的角度来说，一个人成年人每天需要有七到八个小时左右的睡眠时间才能保证身体健康和意识清醒，但朱元璋在洪武十三年以后，一天的睡眠时间可能都没有四个小时——从前一整个部门的工作现在压到他一个人身上，就是他有三头六臂也无法负荷。有史学家统计过，在废除丞相制度以后，每天送到朱元璋面前的奏章有近二百封，大小共计约五百件事需要他做出决断。而那时的奏章都是文四骈六的儒士们写的，通常几万言的水分下来，真正谈事情的能有几百字就不错了，就算一封奏章五千字吧，二百封就是一百万字……就算每天不动脑子看一百万字，你能看完吗？何况还得动脑子去想这奏章到底讲的什么问题，该怎么解决？——面对如此繁重的工作压力，朱元璋再有身为皇帝的自觉也没办法全部一肩扛下。
再说，人的睡眠不足最容易导致精神紧张焦躁，朱元璋本来就不是个和气的人，时间一长，脾气更为暴躁易怒，看着满朝臣子都不顺眼，要不是内廷有结发的妻子马皇后照顾，外廷有皇太子朱标和亲家李善长支撑，只怕他一个暴怒，就能要了满朝大臣的命。
这种情况愈演愈烈，朱元璋看朝臣也越来越不对劲儿。他一个人根本看不完那么多奏章，就有许多推到明天再看，而明天又有新的奏章送到他的面前，必然又有许多得推到第二天。而朝臣们上的奏章都是请示问题与决策，虽有轻重缓急，但却没有不该办的，得不到回复就不敢实行，不敢实行在朱元璋眼里就是办事不力，办事不力就该罚，挨了罚就更不敢自作主张而要事事请示……如此恶性循环，朱元璋和朝臣的关系越来越紧张。
胡惟庸虽然死了，可李善长还在，朝廷中大部分官员仍然是李善长的老部下，他们在胡惟庸死后，朱元璋对他们日益不满的情况下，自然又回到了李善长的羽翼之下，以求平安。但这种做法在朱元璋看来，就成了结党营私和图谋不轨的双重判断。
“射人先射马，擒贼先擒王。”这句古话在朱元璋这里不适用。他要剪除的是李善长代表的文官功臣集团，他确信，这个集团已经腐化变质了，不再是自己的可靠助手，而是分夺权力的对手。
屠杀的理由并不好找。事实上，外廷的大部分政府部门都由这个集团的人把持，即使在洪武十四（1381年）年成立了大理寺和都察院，和刑部一起并称三法司，刑部受天下刑名，都察院纠察，大理寺驳正，形成了大明朝廷正常的司法程序。但三法司的人多为儒士，办案定罪既无眼力也无效率，朱元璋觉得实在靠不住。
锦衣卫挂牌（4）
靠得住的只有自己身边的检校而已。
检校从一诞生就为朱元璋一手掌控，为他立下过汗马功劳，然而检校是个职务名称，不是正式机构，它有侦察权，却不能扣押人犯和判罪量刑，要想让检校发挥更大的作用，就必须赋予他们更多的权力。如果将检校放到外廷文官系统的三法司的话，只会拘泥于国家法律和程序正义，而无法随心所欲。
朱元璋将眼光收回到内廷，放到了自己身边的侍卫亲军上。侍卫亲军是皇帝的私人卫队，将检校们放入其中，并赋予侦察之外的权力也是说得过去的。
洪武十五年（1382年），朱元璋终于决定将锦衣卫推到台面上来了。
早在朱元璋自立为吴王的时候，他就对军队进行了改革，废除了麾下军队中的统军元帅一职——这个职务只能由朱元璋本人来担任，如今称王将来称帝，军权是一丝一毫也不能放松的。他将全军划分为武德、龙骧、豹韬、飞熊、威武、广武、兴武、英武、鹰扬、骁骑、神武、雄武、凤翔、天策、振武、宣武、羽林等十七卫亲军指挥使司，相应地还废除了诸将因袭元朝旧制